Тяжёлому ковиду нашли ещё один ген
Тяжёлому ковиду нашли ещё один ген
10 ноября 2021
Вероятность тяжёлой коронавирусной инфекции зависит от активности гена, влияющего на противовирусную защиту лёгочных клеток.
Тяжесть коронавирусной инфекции COVID-19 зависит от многих факторов: от возраста (пожилые переносят её обычно хуже, чем молодые), от пола (мужчины переносят ковид хуже женщин), от сопутствующих болезней, от генов. Летом мы писали, что в нашем геноме есть тринадцать участков, которые явно влияют на вероятность заразиться SARS-CoV-2 и на то, насколько тяжёлой окажется болезнь. Здесь корректно говорить именно об участках генома, а не о генах, потому что в некоторых случаях получилось установить только зону в той или иной хромосоме, которая влияет на ковид, а вот что именно там находится, ещё предстоит выяснить. Тем не менее, в летней статье в Nature говорилось также и о некоторых генах, которые сумели определить в этих участках.
(Иллюстрация: decade3d / Depositphotos)
Открыть в полном размере
‹
›
В новой статье в Nature Genetics сотрудники Оксфордского университета описывают ещё один ген, который имеет отношение к тяжёлому ковиду. Исследователи изучали участок на третьей хромосоме, про который уже было известно, что он вдвое повышает вероятность умереть от COVID-19 у людей моложе 65 лет. То есть этот участок, конечно, есть у всех людей, но последовательность генетических букв там может несколько отличаться. И вот у некоторых людей участок на третьей хромосоме оказывается в таком варианте, при котором течение COVID-19 очень тяжёлое.
Исследователи проанализировали огромное количество генетических данных из разных типов клеток и пришли к выводу, что ковидные особенности участка третьей хромосомы имеют значение для клеток лёгочного эпителия. Удалось определить, что именно делает этот участок — он оказался энхансером. Так называют последовательности, которые не кодируют никаких белков, но влияют на активность генов. Без энхансера ген хотя и может работать, но вполсилы. Притом энхансерная последовательность необязательно находится рядом со своим геном — энхансер может отстоять от него на тысячи нуклеотидов; более того, у одного энхансера может быть несколько «подопечных» генов, а у одного гена — несколько энхансеров.
В данном случае речь идёт о связке энхансера с геном LZTFL1. В зависимости от того, какой вариант энхансерной последовательности достался человеку, ковидом он будет болеть сильнее или слабее. Энхансер тяжёлого ковида встречается у 60% коренных жителей Южной Азии, а также их потомков в других частях света. Среди людей европейского происхождения опасная последовательность есть у 15%, у людей афро-карибского происхождения — только 2%.
Сам ген LZTFL1
мало изучен, его функции в точности неизвестны. Мы знаем только, что от него зависит, как клетки лёгких реагируют на вирус, но при этом он не входит в число иммунных генов, которые управляют воспалением, синтезом антител, активностью иммунных клеток и т. д. То есть реакция на вакцину от LZTFL1 и его энхансера не зависит. Возможно, изучив LZTFL1 получше, мы сможем создать лекарство, которое не давало бы коронавирусу обосноваться в лёгких.
Источник: